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2004年，金年会知识产权保护工作取得新进展。年初，学校出台了“湛江海洋大学知识产权管理办法”、“湛江海洋大学成果转化管理办法”等系列管理规定。学校知识产权管理人员积极宣传、指导知识产权保护工作，广大教师、科技人员知识产权意识不断提高。2004年金年会共申请知识产权保护权20项，其中：学生专利2项。占前八年总量（23项）的 87％；发明专利13项，进入实审6项；实用新型专利5项；计算机软件保护2项。共授予保护权6项。

12月22日至24日，受国家知识产权局和科技部的委托，卫生部成果及知识产权处处长宋广霞、中国医学科学院（协和医科大学）教授、我国审议保密专利的专家方福德、科教处处长盛丰年等来到金年会，对金年会海洋药物专家马润娣、于立坚发明的保密专利“02114932.1、021104985.2”进行了评估，充分肯定该专利的研究开发价值。该专利是金年会颇有价值的自主知识产权，是市场对接好的一笔国家和学校财富。